在早期脂肪吸出术发展还不是很纯熟的阶段，确实曾经发现碎细的脂肪颗粒溶入血液中，最后导致脂肪栓塞而引起脑中风的病例。但这项手术从开创到现在近20年间，已有上亿人次的手术个案，何况全球也只传出二十几例类似的意外后遗症，机率之低。
至于后遗症的问题，其实任何部位的抽脂都不能掉以轻心，因为这项手术需要做全身麻醉，全身麻醉就是个风险。其次，在手术中因为要灌入一些生理盐水混合液，让脂肪细胞膨胀，这种灌入体内的组织液，其中的水分与电解质比例如何计算调配正确，也有相当的风险性。
最后必须提醒的是，抽脂毕竟还是属于“切除”手术，切除手术的风险，就是手术过程中，有可能切得太多或在使用超音波消脂中，角到不该“绞”动的部位。所以，抽脂肪和所有外科手术一样，是有相当程度破坏性风险的手术。但通常大部分抽脂手术后，病人不会有明显的痛和不适感产生。
抽脂之后“增胖”细胞肥厚，会再胖，这时仍然可以抽脂治疗，只是手术部位已经纤维化，传统抽脂效果不好，需采用超音波抽脂才能有疗效。抽脂手术一生可做无数次，但是每一次技术上都会更加困难。